Plateforme de calcul du Cerveau Virtuel

Le cerveau virtuel (TVB, www.thevirtualbrain.org) est une plateforme de neuroinformatique open source, qui combine un simulateur de réseau cérébral à grande échelle et un simulateur de modalité de neuroimagerie (s / EEG / MEG & IRMf), optimisé pour une connectivité et une géométrie réalistes du cerveau. modèles de masse neuronale, avec un cadre pour la construction, la visualisation et l’analyse des modèles de réseaux cérébraux dans une interface utilisateur collaborative orientée projet, accessible via un navigateur Web (https: //cluster.thevirtualbrain.org). L’utilisation générale est prise en charge via SSH ou Jupyter (https://jupyter.thevirtualbrain.org), en plus de la prise en charge du développement logiciel avec une instance GitLab sur site (https://gitlab.thevirtualbrain.org). Cette plate-forme s’appuie sur un matériel informatique performant dédié, complété par des nœuds en cluster pour les machines virtuelles exécutant des services web publics, situés dans la faculté de médecine du campus de La Timone. Installé en septembre 2011, le cluster comprend un stockage haute performance de 95 To, 2,5 To de RAM, 400 cœurs Xeon et 8 GPU NVidia aux utilisateurs locaux dans les collaborations de modélisation et aux utilisateurs mondiaux de la plateforme TVB.

Les utilisateurs de la plateforme TVB peuvent trouver des informations supplémentaires sur le wiki du cluster TVB ou contacter un membre du personnel.

Personnel

  • Huifang Wang (IR)
  • Marmaduke Woodman (IR)